1979年9月，柳州市柳南區成立。

1990年，柳南區分柳南、柳石、南站、鵝山、河西5個街道，設立5個街道辦事處，分轄37個居民委員會、24條路（街）和28條巷（里）。區域面積27.12平方公里，人口約22.82萬人。

2002年9月，柳州市原郊區西鵝鄉、太陽村鎮的全部和黃村鄉的磨灘、渡口、基隆3個行政村，羊角山鎮的門頭、帽合、新云3個行政村劃歸柳南區。

2005年7月，柳州市部署鄉鎮撤并，改設街道，撤銷西鵝鄉建制，柳南區增設南環、潭西2個街道，同時設立南環、潭西2個街道辦事處，原西鵝鄉的10個行政村分別劃歸太陽村鎮和南環街道。同時，柳南區調整太陽村鎮和部分街道行政區劃，把部分社區、村屯劃歸南環、潭西2個街道。年末，柳南區共劃分為柳南、柳石、南站、鵝山、河西、銀山、南環、潭西8個街道和太陽村鎮1個鎮，分轄50個社區、21個村（鎮居委會）。

2019年5月，調整柳江區、柳南區行政區劃，將柳江區的洛滿鎮、流山鎮劃入柳南區管轄。調整后，柳南區轄太陽村、洛滿、流山3個鎮和河西、柳南、柳石、南站、鵝山、銀山、潭西、南環8個街道。分轄55個城市社區、39個行政村、1個鎮居委會、2個鎮社區。行政區域面積541.37平方公里。